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图 :展示如何解释 RDF 三元组的模式

Posted: Sat Feb 22, 2025 6:50 am
by asimj1
通过以下示例工作流程,我们利用 ChEBI 本体的术语和内容,同时结合搜索、结果和数据,以创建可探索内容的交互式视图。我们希望了解化合物、它们的生物和化学作用以及包含对特定化合物的引用的定义和其他来源。

该分析在图2所示的工作流程中实现,包含以下主要步骤:

步骤 1. 将 OWL 文件读入 SPARQL 端点
第 2 步: 子结构搜索并选择化合物的作用
步骤 3. 查看符合子结构搜索和角色的化合物。此处需要选择一个化合物
步骤 4. 在网络中显示所选化合物及其所有父类、层次结构和角色。在标签云中选择一种疾病,以便在下一步中合并更多数据
步骤 5. 查看步骤 4 中选择的结果

图 :示例工作流程,展示 开曼群岛电话号码数据 如何探索以 OWL 格式存储的 ChEBI 本体。
步骤 .将 OWL 文件读入 SPARQL 端点
类似于前面描述的披萨本体用例,我们使用 三重文件读取器 节点读取 OWL 文件并将三元组列表插入到 SPARQL 端点中,该端点连接到 内存端点 节点(参见图 2,步骤 1)。有了这个,并且成功执行了,我们现在就可以开始编写和执行 SPARQL 查询以及从三元组列表中过滤信息了。

这里快速提醒一下:RDF 三元组(也称为语义三元组)始终包含三列:主语、谓语和宾语。阅读更多 这里。


第 步:结合角色信息的子结构搜索
假设一位科学家正在研究一种正在开发的新化合物。她知道该化合物的化学结构和应用,但想知道 ChEBI 中是否有其他具有类似特性的化合物。在此示例工作流程中, 微笑 可以添加子结构搜索,并选择化合物的应用或生物/化学作用(见图 4)。

因此,“输入搜索选项”组件将用于创建搜索查询,以添加上述属性(右键单击组件→选择交互式视图)。